●国家级科研机构（3个）
土肥资源高效利用国家工程实验室
新农村发展研究院
沈阳山楂国家野外科学观测研究站
●教育部与辽宁省共建科研机构（2个）
北方粳稻遗传育种重点实验室
设施园艺重点实验室
●农业部科研机构（18个）
农业部东北水稻生物学与遗传育种重点实验室
农业部东北耕地保育重点实验室
农业部北方作物生理生态重点开放实验室
农业部东北土壤与环境重点开放实验室
国家果树种质沈阳山楂资源圃
多功效大豆根病防治剂菌线克科技成果转化基地
国家水稻区域技术创新中心
沈阳农业大学国家水稻原原种扩繁基地
北方粳型超级稻成果转化基地
北方超级粳稻原原种扩繁基地
沈阳农业大学东北野生猕猴桃资源异位保存圃
沈阳农业大学秸秆技术研发中心
辽宁东北野菜种质异位保存圃与鉴定中心
沈阳农业大学东北地区农村沼气科技创新示范基地
农业部东北地区蔬菜科学观测实验站
农业部东北玉米营养与施肥科学观测实验站
农业部东北地区作物栽培科学观测实验站
农业部东北设施园艺工程科学观测实验站
●辽宁省科研机构（40个）
辽宁省土壤肥料资源高效利用重点实验室
辽宁省生物炭工程技术研究中心
辽宁省农业生物技术重点实验室
辽宁省北方粳稻育种重点实验室
辽宁省设施园艺重点实验室
辽宁省农业资源与环境重点实验室
辽宁省植物病理重点实验室
辽宁省农业水土工程重点实验室
辽宁省十字花科蔬菜遗传育种重点实验室
辽宁省农业机械化重点实验室
辽宁省生物质能源生物转化技术重点实验室
辽宁省线虫病害与生物控制重点实验室
辽宁省果树品质发育与调控重点实验室
辽宁省工厂化高效农业工程技术研究中心
辽宁省农产品加工工程技术研究中心
辽宁省生物农药工程技术研究中心
辽宁省瘦肉型猪繁育工程技术研究中心
辽宁省玉米育种工程技术研究分中心
辽宁省植物基因工程技术研究中心
辽宁省生物炭工程技术研究中心
辽宁省昆虫资源工程技术研究中心
辽宁省农作物秸秆饲喂反畜家禽配套技术推广中心
辽宁省蔬菜细胞分子育种工程技术研究中心
北方超级粳稻育种重点实验室
辽宁省农作物病害免疫重点实验室
辽宁省设施园艺重点实验室
辽宁省养猪工程技术中心
经济与应用昆虫重点实验室
农产品深加工重点实验室
农业水土重点实验室
蔬菜遗传育种重点实验室
农业机械化重点实验室
北方园林植物与地域景观重点实验室
辽宁省北方粳稻工程实验室
辽宁省设施蔬菜工程实验室
辽宁省蔬菜育种工程实验室
辽宁省设施农业环境与装备工程研究中心
环渤海湾地区设施蔬菜优质高效生产协同创新中心
东北粳稻遗传改良与优质高效生产协同创新中心
辽宁现代农业发展研究基地
●沈阳市科研机构（11个）
沈阳市水稻科研基地
沈阳市果树科研基地
沈阳市旱作节水技术重点实验室
沈阳市农业生物技术重点实验室
沈阳市特种玉米遗传育种与生理重点实验室
沈阳市工厂化高效农业技术研究与服务中心
沈阳市动物胚胎工程技术研究与服务中心
沈阳市农产品加工工程技术中心
沈阳市畜产品加工与安全重点实验室
沈阳市蔬菜细胞与分子育种实验室
沈阳北方果树栽培与生理生态重点实验室
●校级科研机构（29个）
作物生理研究所
水稻研究所
蔬菜品种改良研究所
北方线虫研究所
北方果树育种与生理生态研究所
烟草研究所
水土工程研究所
水资源研究所
植物营养与肥料研究所
土地资源研究所
林业生态研究所
园林科学研究所
数字农业研究所
食品科学研究所
农业机械研究所
柞蚕研究所
农村经济研究所
养猪研究所
特种玉米研究所
生物炭工程技术研究中心
食品营养质量与安全研究所
“三农”研究院
江河水利与水资源研究院
花生研究所
大豆研究所
现代牛业研究中心
畜牧产业经济研究中心
植物免疫研究所
职业能力研究所
